《名侦探柯南：江户川柯南失踪事件》由于亚里医生家的浴室发生故障，江户川柯南（高山南配音）和小兰（山崎佳奈配音）、惠元爱（林元惠美配音）一起去公共浴室泡澡。洗澡。在此期间，柯南不小心滑倒撞到了头，被两个神秘的陌生人带走了。一番迷茫后，天才骗子奈奈（深见理香配音）和神秘杀手近藤（香川辉之配音）将失去记忆的柯南带到一处隐蔽的别墅，假扮柯南的父母追踪近藤等人。阿里博士和慧原则卷入了一场严重的车祸。娜娜所属的犯罪团伙似乎正计划用炸弹制造恐怖袭击。与此同时，为杂志社工作的编辑水岛早苗（广末凉子配音）怀疑丈夫近藤有外遇，要求森小五郎调查丈夫的下落。随着时间的流逝，险恶的阴谋浮出水面……本片是漫画连载20周年特别企划。编剧邀请了导演/编剧内田健二来饰演这个角色。.