《名侦探柯南：贝克街的亡灵》这一天，柯南和小蓝一行人来到了米华市的市政厅，那里正在召开最新游戏《茧》的发布会。因为与以往任何一款游戏截然不同的《破茧成蝶》很可能一举改变了全球游戏产业的价值观，发布会吸引了代表日本上层社会的政界、金融界、娱乐界人士，最50个游戏体验者中有一个是他们的后代。新一的父亲、推理小说大师工藤雄作因为参与了故事的创作也来到了现场。这里热闹热闹，但游戏的开发者兼负责人建存却在地下室遇害。剑村死前留在J、T、R键盘上的鲜血，让柯南认为答案或许就在游戏中。他利用游作的关系加入了测试者队伍，小岚、灰原爱等人也拿到了经验入门券。50名体验者刚刚进入一个看起来像茧的“大胶囊”，游戏由一个自称是“诺亚方舟”的人工智能控制。《诺亚方舟》声称游戏将提供5个完全真实的历史场景，体验者可以选择其中一个进入，如果被淘汰则进入休眠状态。如果最后没有人到达终点，他们的脑组织就会被破坏。这是为了重振日本社会。柯南一行人和几个傲慢无礼的上流社会小子进入了19世纪的伦敦贝克街，凶手开膛手杰克在那里兴风作浪，他得到了柯南要找的答案！游作也在现实中调查此案。