《灵异侦缉档案1》在危险的工作中，叶胜辉（陶大宇饰）开枪打伤了一名无辜的女学生。这场意外，让叶胜辉的事业跌入谷底。不仅如此，他的精神也到了崩溃的边缘。老板把叶生辉送到心理医生李家文（李珊珊饰）那里进行心理治疗。对于叶胜辉身边出现的诡异事件，李嘉文只将之视为叶胜辉的幻觉。叶生辉被调到古董仓库工作。有一个头，已经无人认领了25年。当死者的弟弟姜文杰从远方赶来认领尸体时，就暴露了这起案件与之前的大屠杀的不同。千丝万缕的联系，所有的尖尖都指向了一个叫陈石的男人。后来，叶生辉回到灭门惨案的现场，震惊的发现自己竟然获得了见鬼的特殊能力。