《冷然之天秤》大正25年，东京为帝都。主人公久石画眉中国国籍，为了解脱衰落的家庭而决定结婚。就在这时，弟弟卷入了一本名为《稀有》的书引发的事件。《稀有》承载着作者的灵魂与情感，对读者产生巨大的影响。趁着弟弟的意外，钏路画眉可以看出寄宿生的心情——“稀有物”散发出的“气场”。在迷茫的画眉面前，出现了一些自称属于“帝国图书馆和信息资产管理局”（俗称“猫头鹰”）的人。他们的职责是收集和管理“稀有物体”，并指派画眉协助完成与“稀有物体”相关的观察任务。画眉虽然有些犹豫，但最终还是决定参加“猫头鹰”，开始一场“稀有事物”的观察活动。这是一个像天秤座一样摇摇欲坠的少女命运的故事。