《机器人笔记》故事的舞台设定在了“扩张现实”本领逼近人类生存、世界线变动率为“1.048596%”的2019年的种子岛，中央种子岛高中的机器人部正面临着废部的紧急社团中的两名成员——八汐海翔及濑乃宫秋穗，面临此状况海翔仍旧没有对“机器人部”感兴趣，一心只想着机器人格斗游戏横冲直撞的部长濑乃宫秋穗以“巨大机器人的完成”为目标，为了避免废部而努力搏斗着。