《海底擒谍》在太平洋和大西洋之间的小岛巴库里附近，经常莫名其妙地发生各种船只失踪和沉没的事件。先驱号潜艇奉命调查这起离奇事件。然而，就在先驱号启程前夕，先驱号的出发时间、到达地点等绝密信息被意外泄露。两名嫌疑人中，一人装死逃脱，另一人……