《伽利略少女》故事发生在遥远的2061年,大自然的破坏使地球环境非常恶劣。气温急剧下降,大地被冻住了。注意托斯卡纳,伽利略的三个妹妹住在那里。叶月(新藤圭配音)性格奔放率直,心中有着成为检察官的梦想。Shinyuki(大久保留美配音)性格冷淡,沉默寡言。她有很强的运动神经,实际上需要在她的心脏中保持。星月(Higori料理配音)是一个智商很高的女孩,相当精通机械。在三姐妹中,她的性格最温柔讨人喜欢。一个偶然的机会,三姐妹突然遭到陌生人袭击,袭击者的唯一目标就是获得传说中的“伽利略的遗产”。然而,三姐妹对这份遗产的存在却一无所知。为了不让珍贵的传承落入坏人之手,性格各异的三姐妹决心合作。