《单细胞少女与学校怪谈建校纪念日》一名高校女孩立志成为电影导演，但她的大学入学分数却始终无法达标。某天，她无意间发现了一卷1998年的神秘录影带，收录当时学姐们正在校庆之夜，与鬼玩捉迷藏游戏，竟然就顺利获得理想成绩。女孩随即找了三个死党跟随学姐脚步：一个力大无穷能扛摄影机、一个则正朝网红之路迈进，还有一个不折不扣的哈日御宅族，她们联手青春出击，势在达成各自梦想，鹏程万里。