《调香师第二季》千年前，三界之战，庆帝之子庆泽为救世而跳下仙台，灵魂化作无数碎片，坠落在地。他的弟弟紫苏是复活的哥哥。他不顾天罚，千刀万剐，落入人间。紫苏以焚香为媒介收集清泽的灵魂碎片，在一场人间战争中救出垂死的心怡，将其收为奴隶，将其作为碎片的容器。两人开了一家香店，取名为城香园。拥有碎片的人将被带到这里，石苏将以交换碎片为条件满足求香者的愿望。就这样经历了一次次跌宕起伏的惊心动魄的爱情故事和惊心动魄的梦想之旅。但与此同时，化身国师的反派玄冥，却暗中与五脏俱全的食香兽花灵儿联手。