《电脑奇侠重启》近未来，日本政要为了推进社会的兴盛，颁布正式开启提高智能机器人研究水平的“ARK计划”。秉承着一颗耿直之心的光明寺信彦博士（长岛一茂饰）介入其中，谁知相关负责人竟然假借“ARK计划”名义意图开发军用机器人。在此之后，光明寺博士不明不白死于事变，身后留下了正上大学的女儿美津（佐津川爱美饰）以及还未成年的儿子小胜（池田悠斗饰）。某个夜晚，姐弟俩遭遇一伙不明身份之人的劫持，危机时刻一名神奇男子出手相助，随后该男子竟然现出战斗机器人的模样，他就是光明寺博士生前专门安装了良心回路的智能机器人次郎（入江甚仪饰）。光明寺姐弟的命运由此和次郎搅到一起，而更大的危机和阴谋正向他们逼近……