《不能说的秘密》叶祥伦（周杰伦饰）是淡江艺术高中的化名转学生，父亲（黄秋生饰）是该校的教授。一天，他的同学清仪（曾凯旋饰）带他参观了学校，然后他就直奔学校的旧琴房。他自己弹了一首好歌，却被不知从哪里传来的一首钢琴曲所吸引。他来到一间旧琴房，遇到了卢小雨（桂纶镁饰），纯洁的爱情故事就这样发生了。许久，叶香伦都觉得小玉充满了魔力，却又无法理解她。叶湘伦约小玉在琴房见面。叶湘伦觉得青衣就是小鱼，亲吻青衣的时候被小鱼看到了。从此，叶祥伦再也没见过小玉。叶湘伦四处寻找小鱼，将小鱼所说的“不可告人的秘密”的全部真相编造出来。