《柏林2013》在德国首都柏林，一波三折的军火交易，让朝韩两军对峙逼近白热化。朝鲜大使李学洙（李京英饰）和间谍表钟成（河正宇饰）发现了另一个来自祖国的冷血间谍董明洙（柳承范饰）)，在柏林。在此期间，宗盛不得不听从党的指示，监视他的妻子、大使的私人翻译狮子正熙（全智贤饰）的下落。另一方面，在军火贸易调查中遭遇挫折的韩国情报机构负责人康部长（韩锡奎饰）不甘失败，追查钟成的踪迹。在大使的叛逃计划失败后，宗盛得知了董明修来柏林的真正手段。为了避免成为权力斗争的牺牲品和收拾残局，他不得不带着妻子逃亡……