《暗算》本剧包括、和三篇。第一篇故事发生在解放初期，国家秘密机构701成员安在天（柳云龙）费尽千辛万苦找来有超常听觉天赋的瞎子阿炳（王宝强），让他协助政府找出在台人民党与其在大陆的剩余势力联络的电台，以便控制情报将他们一一歼灭。第二篇故事发生在1960年代初，留过洋的爱国数学天才黄依依（陈澍）因为迷上安在天，随他来到701为国家破解密码，其天性也因环境的改变发生变化。第三篇故事发生在1930年代的上海，潜伏在国民党内的共产党员、安在天的父亲钱之江（柳云龙）为了将事关同仁生死存亡的情报及时送出，斗智斗勇与众国民党人士展开斡旋。