《SPEC：零》相识前一年的2009年，玛莎彩（户田绘里香饰）与世文芬露（加濑凉饰）相识。从美国联邦调查局留学归来的弹马，在组长野村幸太郎的直接指导下，被分配到了警视厅公安部第五课未知事件特别对策部。不久前，一家大型石油公司的高管被一个又一个的肢解，死者的心无一例外都被双手捏住了。显然，这一系列事件与所谓的SPEC持有者有着极好的联系。与此同时，石油公司高管暗黑破坏神（大杉仁饰）以高薪聘请了神秘的SPEC持有者十一（高野神木），企图阻止神秘的SPEC杀手。十一时，这个与当妈和塞文有着莫名联系的难缠的对手，把当妈当成了杀了父母、后来又杀了当妈在美国相识的朋友南希的爆炸性女孩。SPEC盛大的篇章从此拉开序幕，决定世界命运的盛会也进入了倒计时……