《SPEC》日本警视厅特别队（SIT）队长濑户分流（加濑亮饰）在执行任务时遭遇队友离奇死亡。面对高层，他无法辩解，最终被调到公安部第五科——不明事件调查科。这个部门专门调查一些离奇的超自然案件。当然，在所谓的现代社会，这也意味着第五课是一个难以被认可的边缘系。第五课除了塞顿之外，只有圆滑的老板野野村幸太郎和智商为201的奇女子绫绫（户田英梨香饰）。在此期间，各种拥有超能力（SPEC）的角色如先知、手众神相继出现。在与当麻一起办案的过程中，塞顿逐渐走近了一个鲜为人知的充满阴谋和谜团的未知世界……